基于生物信息学方法探讨白花蛇舌草-半枝莲抗乳腺癌的分子机制

• 作者: 张誉宝 孙长岗
• 来源期刊: 精准医学杂志
• 关键词: 乳腺肿瘤 计算生物学 基因表达谱 分子对接模拟 白花蛇舌草 半枝莲 网络药理学 药物疗法,计算机辅助
• 年，卷（期）: 2021,（3）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 271-275
• 页数: 5页
• 分类号: R737.9|R319
• 语种: 中文
• DOI: 10.13362/j.jpmed.202103020

摘要

目的 通过生物信息学及网络药理学方法,探讨白花蛇舌草(HDW)-半枝莲(SB)治疗乳腺癌(BC)的分子机制.方法 通过中药系统药理数据库(TCMSP)筛选HDW-SB共同有效成分及有效成分的潜在靶点基因,使用基因表达综合数据库(GEO)中GSE45827芯片筛选出BC组织和癌旁正常组织差异表达基因(DEGs),建立HDW-SB共同有效成分所调控的BC靶点的蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络,经拓扑分析和预后价值分析筛选出BC关键靶点.最后,通过对BC关键靶点与HDW-SB共同有效成分进行分子对接,筛选出HDW-SB核心有效成分.结果 共鉴定出25种HDW-SB共同有效成分,并筛选出544个BC DEGs,分别构建BC DEGs和HDW-SB共同有效成分所调控的BC靶点的PPI网络;拓扑分析和预后价值分析确定BC的关键靶点为HSPB1、CCNA2和NQO1,分子对接分析显示,HDW-SB治疗BC的核心有效成分为quercetin、rhamnoside和luteolin.结论 HWD-SB可能是通过干预HSPB1、CCNA2和NQO1达到治疗BC的作用.