RPUSD1基因在骨肉瘤中的表达及其预后价值分析

• 作者: 李纯璞 张立清 侯存强 李红岩 于鑫 张开刚 郭冬梅
• 来源期刊: 中国矫形外科杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 骨肉瘤 RPUSD1基因 生物信息学 预后 生物标志物
• 年，卷（期）: 2021,（2）
• 所属期刊栏目: 基础研究
• 页码范围: 149-153
• 页数: 5页
• 分类号: R738.1
• 语种: 中文
• DOI: 10.3977/j.issn.1005-8478.2021.02.13

摘要

[目的]采用综合生物信息学方法探索RPUSD1在骨肉瘤细胞中的表达及预后意义.[方法]从GEO(gene expres-sion omnibus,GEO)芯片数据库收集骨肉瘤基因芯片原始数据,并下载基因表达谱资料及临床信息资料.采用Wilcoxon rank-sum检验明确RPUSD1在骨肉瘤细胞和对照细胞中的表达差异;采用Kaplan-Meier和Cox比例风险回归方法进行生存分析;利用基因集富集分析(gene set enrichment analysis,GSEA)和基因集变异分析(gene set variation analysis,GSVA)方法,分析骨肉瘤中RPUSD1调控的相关信号通路.[结果]RPUSD1在骨肉瘤细胞中显著高表达(P＜0.05).RPUSD1高表达组的骨肉瘤患者总体生存率低(P=0.011).RPUSD1是影响骨肉瘤预后的独立因素(P＜0.05).GSEA和GSVA分析结果显示,RPUSD1通过调节细胞代谢和遗传信息传导相关通路影响骨肉瘤的发展.[结论]RPUSD1是骨肉瘤的独立预后生物标志物,有望成为骨肉瘤的治疗靶点.