乳腺癌组织及正常乳腺组织基因表达差异分析

• 作者: 马建萍 宋连川
• 来源期刊: 生物技术
• 关键词: 乳腺癌 基因芯片 差异表达基因 预后
• 年，卷（期）: 2021,（1）
• 所属期刊栏目: 开发与应用|Development and Application
• 页码范围: 71-74
• 页数: 4页
• 分类号: R737.9
• 语种: 中文
• DOI: 10.16519/j.cnki.1004-311x.2021.01.0011

摘要

[目的]基于GEO数据库中乳腺癌相关基因表达谱芯片,探讨乳腺癌组织及正常乳腺组织基因表达差异.[方法]收集2016年10月～2017年10月于医院进行乳腺癌根治术患者乳腺癌组织及其对应正常乳腺组织,共213对样本.GEO数据库提取乳腺癌相关基因表达谱芯片数据,根据筛选基因对应基因差异倍数(FC)对数值,定义表达上调和下调基因.检测关键基因mRNA表达水平,分析其水平对患者总生存期的影响.[结果]共347个基因在乳腺癌组织出现差异表达,其中包括表达上调基因207个,表达下调基因140个;乳腺癌组织与正常乳腺组织差异表达基因差异倍数前 10位基因依次为 KRT19、CENPE、FOXM1、CD9、BUB1B、CDC20、NDC80、CENPE、NUSAP1、GATA3;KRT19、CENPE、FOXM1高表达的乳腺癌患者总生存期显著差于低表达者(P＜0.05).[结论]基于GEO数据库中乳腺癌相关基因表达谱芯片,乳腺癌组织及正常乳腺组织存在差异表达基因,且KRT19、CENPE、FOXM1过表达为乳腺癌患者不利的预后因素,有可能成为乳腺癌基因治疗新靶点.