基于高通量测序研究锦屏极深岩层微生物多样性

• 作者: 李雪丹 徐绯 王璨 徐恒
• 来源期刊: 四川大学学报（自然科学版）
• 学科: 生物学
• 关键词: 微生物多样性 16s rDNA 极端环境微生物
• 年，卷（期）: 2021,（1）
• 所属期刊栏目: 生物学
• 页码范围: 165-172
• 页数: 8页
• 分类号: Q938
• 语种: 中文
• DOI: 10.19907/j.0490-6756.2021.016004

摘要

本研究旨在探索中国锦屏地下原始极深环境中极端微生物群落结构及功能.本研究采用高通量测序技术对锦屏极深环境中4个岩石样品和7个水样中存在的微生物群落进行了研究,共获得732477条高质量序列(Clean tags),可聚类到1318个有效OTUs,各样品菌群之间存在一定差异,但其优势菌门一致,为变形菌门(Proteobacteria)、放线菌门(A ctinobac-teria)、拟杆菌门(Bacteroidetes)和厚壁菌门(Firmicutes).采用PICRUSt分析了样品菌群对应的基因功能,结果表明涉及碳水化合物代谢、氨基酸代谢、能量代谢、辅助因子和维生素代谢等基因功能的丰度最高.结果表明锦屏地下原始极深环境中微生物群落复杂,但主要菌群相对稳定.