辣椒PEBP基因家族的全基因组鉴定、比较进化与组织表达分析

• 作者: 牛西强 罗潇云 康凯程 黄先忠 胡能兵 隋益虎 艾昊
• 来源期刊: 园艺学报
• 关键词: 辣椒 成花素 PEBP基因家族 全基因组鉴定 开花调控 基因表达
• 年，卷（期）: 2021,（5）
• 所属期刊栏目: 研究论文|Research Papers
• 页码范围: 947-959
• 页数: 13页
• 分类号: S641.3
• 语种: 中文
• DOI: 10.16420/j.issn.0513-353x.2020-0800

摘要

植物磷脂酰乙醇胺结合蛋白(Phosphatidyl ethanolamine-binding protein,PEBP)分为MFT、FT和TFL1共3个亚家族,其中FT和TFL1亚家族蛋白构成了植物的成花激素—抗成花激素系统,调控开花时间和株形结构.基于辣椒(Capsicum annuum)全基因组数据,对辣椒PEBP基因家族进行鉴定,并对基因和蛋白结构、比较进化、共线性和组织表达特征等进行了分析.结果 表明,辣椒基因组包含9个PEBP成员,并且9个基因均含有4个外显子和3个内含子,定位在6条染色体上,其编码蛋白质定位在细胞质和细胞核中.与番茄PEBP同源基因的比较进化分析表明,辣椒的PEBP基因受纯化选择,其中CaFT2和CaFT4在进化中较稳定,辣椒和番茄之间存在8对共线性基因.qRT-PCR分析表明CaPEBP基因在所检测的组织中明显差异表达,如CaMFT/CaTFL1-1在果实中高表达,CaFT1在叶片中相对表达量最高,CaFT3在顶端分生组织和花中表达量最高,CaTFL1-4在根中特异表达.