2006-2016年贵州省炭疽芽胞杆菌SNR分型分析

• 作者: 马青 杨平 刘英 王月 聂炜 姚光海 李世军
• 来源期刊: 中国人兽共患病学报
• 关键词: 炭疽 炭疽芽胞杆菌 单核苷酸重复序列分析 聚类分析
• 年，卷（期）: 2021,（3）
• 所属期刊栏目: 监测分析|Communicable Disease Surveillance
• 页码范围: 230-235
• 页数: 6页
• 分类号: R378.7
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1002-2694.2021.00.023

摘要

目的 对贵州省2006-2016年分离的炭疽芽胞杆菌进行单核苷酸重复序列分型分析(SNR),了解菌株SNR型别特征,为炭疽疫情监测、调查与溯源提供技术手段和科学依据.方法 提取贵州省2006-2016年间不同地区的炭疽芽胞杆菌菌株基因组DNA,应用SNR各位点引物进行PCR扩增,将扩增产物进行毛细管电泳分析获得各位点序列长度.运用Bionumerics 7.6软件将扩增长度片段信息进行聚类分析获得各菌株SNR型别并构建最小间距图.结果 来自贵州省2006-2016年间的71株炭疽芽胞杆菌被分为37个SNR型;聚类分析显示,71株菌株被分为A和B两群,其中A群共有27个分支,又可分为A1和A2两个亚群;B群共有10个分支,可分为B1和B2两个亚群.最小间距图显示,71株菌株被分别为7个SNR克隆群(complex)和5个单一的SNR型(singleton).结论 来自贵州省2006-2016年间的71株炭疽芽胞杆菌共分为37个SNR型,SNR型别具有多样性;SNR分子分型方法对炭疽芽胞杆菌分型具有高分辨率的特点,SNR型别分布与菌株的时间和地域分布具有一定相关性.