肝细胞内质网应激对tsRNA表达谱的影响及其功能研究

• 作者: 李涵 潘勤
• 来源期刊: 医学研究杂志
• 学科: 医学
• 关键词: tsRNA 内质网应激 肝细胞 生物信息学
• 年，卷（期）: 2021,（1）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 27-32
• 页数: 6页
• 分类号: R575.5
• 语种: 中文
• DOI: 10.11969/j.issn.1673-548X.2021.01.007

摘要

目的 探讨肝细胞内质网应激相关的tRNA衍生性小RNA(tRNA derived small RNA,tsRNA)表达谱及其功能特征.方法 将AML12细胞随机分为对照组和高脂组,采用棕榈酸刺激高脂组,建立肝细胞内质网应激模型.以RT-qPCR和Western blot法检测内质网应激标志蛋白GRP78和CHOP的表达,油红O染色法观察脂滴生成情况.通过高通量测序技术检测tsRNA表达谱并筛选出差异基因.利用生物信息学分析预测差异tsRNA的靶基因,并通过GO分析和KEGG分析研究差异tsR-NA的潜在功能.结果 与对照组比较,棕榈酸干预导致高脂组GRP78和CHOP表达在mRNA及蛋白水平均显著升高(P<0.05),脂肪变性显著加重.tsRNA测序得到38条差异tsRNA(倍数变化>2,P<0.05).GO分析显示,差异tsRNA的靶基因主要调控类黄酮代谢、葡萄糖醛酸代谢和岩藻糖基化等功能.KEGG分析显示,差异tsRNA的靶基因在戊糖和葡萄糖醛酸酯的相互转化、淀粉和蔗糖代谢、cAMP及Rap1等肝细胞代谢相关的信号通路中高度富集.结论 内质网应激可显著改变肝细胞的tsRNA表达谱,其功能可能与调控肝脏糖代谢及生物转化作用有关.