利用BSA-Seq方法鉴定谷丰B抗稻瘟病基因

• 作者: 陈子强 陈松彪 郭新睿 颜静宛 田大刚 李刚 王锋
• 来源期刊: 福建农业学报
• 关键词: 水稻 稻瘟病 抗性基因 谷丰B BSA
• 年，卷（期）: 2021,（1）
• 所属期刊栏目: 植物保护|Plant Protection
• 页码范围: 36-40
• 页数: 5页
• 分类号: S435
• 语种: 中文
• DOI: 10.19303/j.issn.1008-0384.2021.01.005

摘要

[目的]挖掘和鉴定谷丰B稻瘟病抗性基因,了解谷丰B稻瘟病抗性遗传模式.[方法]以谷丰B和日本晴杂交获得F1和F2代遗传群体,接种稻瘟菌不同生理小种并分析抗病遗传模式;在F2群体中挑选极端抗/感单株构建DNA混合池,利用群体分离分析法(BSA)定位关联区域.[结果]谷丰B对KJ201、RB22、CHNOS、RB6、2Y838-1、501-3和IR16-1等菌株均表现高抗性,表明谷丰B基因组可能携带了广谱高抗稻瘟病基因.谷丰B和日本晴杂交,F1群体表现抗501-3和IR16-1,F2群体的抗病/感病分离比不符合3:1,推测谷丰B基因组存在多个位点影响稻瘟病抗性.对F2群体的极端抗病、感病混合池及亲本DNA进行全基因组测序,鉴定了1756964个单核苷酸多态性(SNPs)标记.分析子代△SNP-index,定位到2个与抗病性显著关联区间,分别为Chr.6:?10082-11397?kb和Chr.11:?120-266?kb.其中,6号染色体的关联区间与Pi2/9抗病位点等位,区间内含有4006个SNPs和623个插入缺失(InDels)标记;11号染色体的关联区间含有752个SNPs和195个InDels标记.[结论]谷丰B对强致病力501-3菌株抗性可能是由第6号和11号染色体上的基因共同控制.研究结果为谷丰B抗性基因的精细定位及基因克隆奠定了基础,并为水稻抗稻瘟病分子标记辅助选择提供标记资源.