小鼠骨骼肌纤维类型定量PCR内参基因的筛选

• 作者: 张静 熊燕 华永琳 郭玉 熊显荣 字向东 李键
• 来源期刊: 生物技术通报
• 关键词: 小鼠 骨骼肌纤维 内参基因 RT-PCR
• 年，卷（期）: 2021,（2）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 71-79
• 页数: 9页
• 语种: 中文
• DOI: 10.13560/j.cnki.biotech.bull.1985.2020-0540

摘要

旨在筛选定量PCR检测不同骨骼肌纤维类型的稳定内参基因,为骨骼肌的能量和糖代谢等功能研究提供基础数据.试验选用6周龄小鼠,采集腓肠肌(Gastrocnemius muscle,GAS)、比目鱼肌(Soleus,SOL)、胫骨前肌(Tibialis anterior muscle,TA)和趾长伸肌(Extensor digitorum longus,EDL)为试验材料.以荧光定量PCR法检测Gapdh、Actb、Rer1、Hprt1、Ppia、Rpl7、B2m、Sdha和Rpl27等9个内参基因的mRNA水平,并采用Delta CT、geNorm、NormFinder、BestKeeper和RefFinder五种方法对其表达稳定性进行评估.结果显示,Delta CT法分析稳定性前3个基因为Rpl7>Actb>Rer1,以NormFinder法分析稳定性前3个基因是Rpl7>Rer1>Actb,以BestKeeper法分析稳定性前3个基因是Rpl7>Gapdh>Actb,而以geNorm法分析稳定性前3个基因是Actb>B2m>Rpl27.最后通过RefFinder法综合分析Rpl7是最稳定的内参基因,且5种方法中Ppia均最不稳定.因此,Rpl7可作为小鼠骨骼肌纤维类型检测的稳定内参基因.