葡萄座腔菌(Botryosphaeria dothidea)全基因组分泌蛋白的预测及功能分析

• 作者: 臧睿 宋璐璐 尹新明 徐超 耿月华 张猛
• 来源期刊: 植物病理学报
• 关键词: 葡萄座腔菌 分泌蛋白 效应蛋白 碳水化合物活性酶
• 年，卷（期）: 2021,（4）
• 所属期刊栏目: 细胞生物学、生理学、生物化学、分子生物学|CELL BIOLOGY,PHYSIOLOGY,BIOCHEMISTRY,AND MOLECULAR BIOLOGY
• 页码范围: 559-571
• 页数: 13页
• 分类号: S432.1
• 语种: 中文
• DOI: 10.13926/j.cnki.apps.000732

摘要

葡萄座腔菌(Botryosphaeria dothidea)是引起多种果树和林木枝干溃疡病和果实腐烂病的重要病原菌.为明确葡萄座腔菌的致病机理,采用SignalP、WoLF PSORT、TMHMM、GPI-SOM等软件,对葡萄座腔菌全基因组14 998条蛋白序列进行了分泌蛋白预测和功能分析.结果表明B.dothidea全基因组编码蛋白中有851条序列具有典型的分泌蛋白特征,占蛋白总数的5.67％,其长度主要分布在100～700个氨基酸范围内.信号肽的分析结果表明,以19个氨基酸为信号肽的分泌蛋白数目最多,非极性氨基酸丙氨酸(A)在信号肽中的使用频率最高,而有带电侧链的天冬氨酸(D)和谷氨酸(E)使用频率最低,信号肽-3和-1位置的氨基酸相对保守,其切割位点属于典型的A-X-A型.对分泌蛋白功能预测结果表明,578个分泌蛋白获得了功能注释,其功能主要涉及碳水化合物的运输、代谢过程,蛋白翻译后修饰和氨基酸代谢、运输过程.分泌蛋白中效应蛋白(effector)预测结果表明,B.dothidea分泌蛋白中共有119个潜在的效应蛋白,其中11个可被PHI数据库注释到,其与引起其他植物病原菌致病力变化的致病效应蛋白具有较高的相似性.碳水化合物活性酶类(CAZymes)的预测结果表明,B.dothidea分泌蛋白组中共有279个CAZymes,其中GHs家族最多.这些结果的获得为今后进一步筛选B.do-thidea的效应蛋白,明确B.dothidea的致病机理,以及筛选寄主新的抗性基因提供了必要的基础.