小鼠心肌肥厚枢纽基因的筛选与鉴定

• 作者: 史卓 李家慧 高静 董艳莉 任甫 文普帅
• 来源期刊: 解剖学报
• 关键词: 心肌肥厚 生物信息学 差异表达基因 实时定量聚合酶链反应 昆明小鼠
• 年，卷（期）: 2021,（3）
• 所属期刊栏目: 细胞和分子生物学|Cell and Molecular Biology
• 页码范围: 391-397
• 页数: 7页
• 分类号: R361
• 语种: 中文
• DOI: 10.16098/j.issn.0529-1356.2021.03.010

摘要

目的 通过生物信息学分析结合生物学实验,筛选和鉴定与心肌肥厚密切相关的枢纽基因.方法从基因表达数据库(GEO)下载小鼠心肌肥厚相关芯片数据,利用GEO2R在线工具筛选差异表达基因;利用DAVID 6.7、String 11.0和Cytoscape 3.7.0软件对差异基因进行分析;昆明小鼠随机分为生理盐水组(n = 6)和血管紧张素Ⅱ(Ang Ⅱ)组(n = 6),建立心肌肥厚模型,通过Real-time PCR方法检测枢纽基因在Ang Ⅱ诱导的昆明小鼠心肌肥厚模型中的表达.结果 筛选出共有差异表达基因202个,枢纽基因12个;Real-time PCR结果显示核心蛋白聚糖(Dcn)、HADHA和热休克蛋白(HSP)90αA1在AngⅡ组中表达明显下调.结论 筛选出的枢纽基因可以通过细胞外基质和转化生长因子β(TGF-β)影响昆明小鼠心肌肥厚的发生发展.