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10种鲤形目鱼类ZP2基因的克隆及特征分析
10种鲤形目鱼类ZP2基因的克隆及特征分析
作者:
陈沙
刘焕章
曹文宣
俞丹
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
鲤形目
ZP2
克隆
序列分析
选择压力
摘要:
利用RT-PCR技术克隆了10种鲤形目Cypriniformes鱼类卵透明带蛋白(ZP2)基因的cDNA全长序列,并初步探讨了这些鱼类ZP2基因的重复结构域变异与产卵习性的相关性.序列分析表明,10种鲤形目鱼类ZP2基因cDNA序列长度差异较大(1254~1734 bp),其编码的氨基酸保守结构域集中在N端信号肽序列、三叶草结构域和ZP结构域,变异集中在N端重复结构域中,不同物种的重复单元和重复次数不同,其中产漂流性卵和产沉性卵鱼类的重复结构域不含重复单元或重复单元重复次数较少(2~5次),而产粘性卵鱼类的重复结构域中通常含有多次重复单元(7~19次).同源性分析结果显示,在鲤形目鱼类中,团头鲂Megalobrama amblycephala与鳊Parabramis pe-kinensis的相似性最高(99.7%),斑马鱼Danio rerio和鲫Carassius auratus的相似性最低(71.2%).系统进化分析显示,鲤形目鱼类的ZP2氨基酸序列聚为一个单系,其中斑马鱼单独聚为一支,位于系统树的基部位置,与其他鲤形目鱼类形成姐妹群.10种鲤形目鱼类ZP2蛋白的二级结构成分和三维结构均存在一定的差异.进化选择压力分析结果表明,ZP2基因在鲤形目鱼类中受到正向选择,可能对其功能产生影响.
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文献信息
篇名
10种鲤形目鱼类ZP2基因的克隆及特征分析
来源期刊
四川动物
学科
关键词
鲤形目
ZP2
克隆
序列分析
选择压力
年,卷(期)
2021,(3)
所属期刊栏目
研究报告
研究方向
页码范围
241-253
页数
13页
分类号
Q959.4
字数
语种
中文
DOI
10.11984/j.issn.1000-7083.20200425
五维指标
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主办单位:
四川省动物学会
四川省野生动植物保护协会
四川大学
成都大熊猫繁育研究基金会
出版周期:
双月刊
ISSN:
1000-7083
CN:
51-1193/Q
开本:
大16开
出版地:
成都市望江路29号四川大学生命科学学院内
邮发代号:
创刊时间:
1981
语种:
chi
出版文献量(篇)
4190
总下载数(次)
12
总被引数(次)
21965
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