苏×柯杂交猪肠道不同部位菌群结构的研究

• 作者: 杨莲 燕志宏 吴光松 顾丽菊 张芸 江冰 谢宗福 廖志莹
• 来源期刊: 生物技术
• 关键词: 苏×柯杂交猪 肠道菌群 高通量测序 生物信息学分析 alpha多样性分析
• 年，卷（期）: 2021,（3）
• 所属期刊栏目: 技术与方法|Technique and Method
• 页码范围: 245-253,216
• 页数: 10页
• 分类号: S828
• 语种: 中文
• DOI: 10.16519/j.cnki.1004-311x.2021.03.0038

摘要

[目的]为了研究苏×柯杂交猪肠道不同部位菌群结构.[方法]9头苏×柯杂交猪在同等条件下养殖,达屠宰体重后(100 kg左右),随机选3头屠宰,取十二指肠、空肠、回肠、结肠肠道内容物,进行高通量测序和生物信息学分析.[结果]结果表明,苏x柯杂交猪结肠和小肠段Alpha多样性指数差异显著(P＜0.05);肠道菌群结构分析显示,厚壁菌门(＞63.78％)和变形菌门(＞3.02％)在苏x柯杂交猪小肠肠道菌群中占绝对优势,厚壁菌门(59.45％)和拟杆菌门(33.51％)构成苏×柯杂交猪结肠优势菌门;瘤胃球菌属、拟普雷沃菌属、密螺旋体属等纤维降解菌属在结肠的相对丰度显著高于小肠段(P＜0.05),LEfSe分析,发现苏×柯杂交猪结肠肠道富集着大量的产短链脂肪酸菌群.[结论]随着肠道自上而下,苏x柯杂交猪肠道菌群丰富度和多样性逐渐增加;在属水平上,苏×柯杂交猪结肠和小肠段中纤维降解菌表现出差异,结肠内纤维降解菌的比例较高,说明小肠段对粗纤维的消化能力较弱于结肠.