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金乌贼热休克蛋白基因的挖掘及对低盐胁迫的响应
金乌贼热休克蛋白基因的挖掘及对低盐胁迫的响应
作者:
王兴强
郑年昊
崔春辉
曹梅
沈晔
刘莹
张子文
汤子威
秦传新
陈百尧
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
金乌贼(Sepia esculenta)
低盐胁迫
肌动蛋白
热休克蛋白
晶体蛋白
摘要:
热休克蛋白(heat shock proteins:HSPs)为动植物响应外界胁迫产生的一类蛋白质,能有效改善机体对外界胁迫的适应能力.本研究基于先前获得的低盐胁迫金乌贼(Sepia esculenta)高通量转录组数据,对与低盐胁迫密切相关的热休克蛋白(热休克蛋白家族和晶体蛋白(crystallin)家族)基因进行挖掘;鉴于实时定量内参基因筛选,同时挖掘出金乌贼肌动蛋白(actin)家族系列基因;然后,对肌动蛋白、热休克蛋白和晶体蛋白家族基因及其编码的氨基酸序列进行生物信息学分析并探究低盐胁迫对金乌贼热休克蛋白和晶体蛋白家族基因表达的影响.金乌贼肌动蛋白家族基因包括actin、内收肌actin、胞质actin、actin 1、actinⅡ和βactin 6个成员,热休克蛋白家族基因包括HSPβ、小HSP、HSP 10、HSP 16、HSP 30、HSP 60、HSP 70、HSP 75、HSP 90α、HSP 90和HSP 90β11个成员,金乌贼晶体蛋白家族基因包括S crystallin、S crystallin 6、S crystallin SL18和O crystallin 4个成员.氨基酸序列比对发现,肌动蛋白家族6个基因共享甘氨酸、精氨酸、丝氨酸、异亮氨酸、苏氨酸和天冬氨酸等13个位点,晶体蛋白家族4个基因共享苯丙氨酸、天冬酰胺、甘氨酸、天冬氨酸、脯氨酸、精氨酸、酪氨酸、丝氨酸和半胱氨酸等17个位点,而热休克蛋白家族HSPβ、小HSP、HSP 10、HSP 16和HSP 305个基因共享1个甘氨酸位点和4个保守位点,HSP 60、HSP 70、HSP 75、HSP 90α、HSP 90和HSP 90β6个基因仅共享2个保守位点.实时定量结果发现,低盐胁迫可以明显提高金乌贼HSPβ、HSP 16、HSP 30和HSP 70的基因表达,而明显降低晶体蛋白家族基因的表达,表明在低盐胁迫条件下,金乌贼热休克蛋白家族基因通过自身的差异表达来提高机体对外界胁迫的适应防御能力.
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昆虫
滞育
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热休克蛋白
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蛋白组学
内容分析
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相关基金
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内容分析
关键词云
关键词热度
相关文献总数
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文献信息
篇名
金乌贼热休克蛋白基因的挖掘及对低盐胁迫的响应
来源期刊
海洋科学
学科
关键词
金乌贼(Sepia esculenta)
低盐胁迫
肌动蛋白
热休克蛋白
晶体蛋白
年,卷(期)
2021,(3)
所属期刊栏目
研究报告|REPORTS
研究方向
页码范围
59-70
页数
12页
分类号
Q768
字数
语种
中文
DOI
10.11759/hykx20200503003
五维指标
传播情况
被引次数趋势
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(/年)
引文网络
引文网络
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共引文献
(56)
参考文献
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节点文献
金乌贼(Sepia esculenta)
低盐胁迫
肌动蛋白
热休克蛋白
晶体蛋白
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
海洋科学
主办单位:
中国科学院海洋研究所
出版周期:
月刊
ISSN:
1000-3096
CN:
37-1151/P
开本:
16开
出版地:
山东省青岛市南海路7号中科院海洋所
邮发代号:
2-655
创刊时间:
1977
语种:
chi
出版文献量(篇)
4831
总下载数(次)
9
总被引数(次)
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