铁死亡相关基因在转移性骨肉瘤中的作用机制

• 作者: 童也 周浩远 赵鹏 徐海栋
• 来源期刊: 医学研究生学报
• 关键词: 骨肉瘤 转移 铁死亡相关基因 GEO
• 年，卷（期）: 2021,（5）
• 所属期刊栏目: 基础研究|Basic Research
• 页码范围: 457-462
• 页数: 6页
• 分类号: R738.7
• 语种: 中文
• DOI: 10.16571/j.cnki.1008-8199.2021.05.003

摘要

目的 目前铁死亡在骨肉瘤疾病进展中的作用机制仍不清楚.文中旨在探讨铁死亡相关基因在转移性骨肉瘤中的潜在作用机制.方法 采用GEO数据库中的骨肉瘤芯片数据,通过limma包在GSE21257中筛选骨肉瘤转移组与非转移组间的差异表达基因(DEGs).利用基因集富集分析(GSEA)对DEGs进行GO与KEGG富集分析.将DEGs与铁死亡相关的基因取交集,得到铁死亡相关的DEGs.基于表达量的中位数,将铁死亡DEGs分为高、低表达,结合其对应的临床生存数据,通过survival包对铁死亡DEGs进行生存分析,鉴定出预后相关的铁死亡DEGs.在合并的数据集(GSE14827、GSE32981)中对预后相关的铁死亡DEGs进行验证.通过多因素Cox回归分析找出骨肉瘤的预后因素.结果 在GSE21257中,转移组与非转移组骨肉瘤样本中共筛选出632个DEGs.GO富集分析结果表明,DEGs主要富集的生物学过程有适应性免疫应答、细胞激活、免疫反应相关的细胞活化以及防御应答.KEGG富集分析的结果发现共有17条通路被DEGs显著富集.DEGs与259个铁死亡相关基因通过取交集,共得到11个铁死亡DEGs,分别为ATF4、FANCD2、HSPB1、TMBIM4等.生存分析的结果表明,FANCD2、HSPB1和ATF4高表达的骨肉瘤患者整体生存率显著低于低表达患者(P<0.05),而TMBIM4则与之相反.ATF4、FANCD2和HSPB1在骨肉瘤转移组中的表达显著高于非转移组,TMBIM4在转移组中的表达显著低于非转移组(P<0.05).Cox分析发现FANCD2是骨肉瘤的预后的危险因素(P=0.02).结论 FANCD2、HSPB1、ATF4和TMBIM4在转移性骨肉瘤组织中的异常表达会减少肿瘤细胞铁死亡相关的细胞凋亡,从而促进骨肉瘤的疾病进展.