1株产GES⁃1型碳青霉烯酶铜绿假单胞菌的全基因组测序分析

• 作者: 郭庆昕 蔡加昌 周宏伟 张嵘 蒋华蔚 胡燕燕
• 来源期刊: 临床检验杂志
• 关键词: 碳青霉烯酶 铜绿假单胞菌 blaGES-1 基因环境 全基因测序
• 年，卷（期）: 2021,（5）
• 所属期刊栏目: 临床实验研究
• 页码范围: 362-366
• 页数: 5页
• 分类号: R446.5
• 语种: 中文
• DOI: 10.13602/j.cnki.jcls.2021.05.10

摘要

目的 了解产GES?1型碳青霉烯酶铜绿假单胞菌的分子流行特征.方法 采用Illumina HiSeq X10测序平台对1株产GES?1型碳青霉烯酶铜绿假单胞菌进行全基因组测序,通过Kleborate和ResFinder分析菌株的多位点序例分型(MLST)、毒力基因和抗菌药物耐药基因,并分析blaGES?1基因的周围环境.结果 经比对,本菌为ST235型,血清分型为O11型,共携带12个抗菌药物耐药基因,分别为aac(6′)?Ⅰb3、aadA10、aph(3′)?Ⅱb、aph(3′)?XV、blaGES?1、blaOXA?50、blaPAO、crpP、sul1、tet(G)、fosA、catB7;blaGES?1位于含有3150 bp的NODE_219片段中,该片段与GenBank中的KY860573菌株的72068—75217序列99.94％一致.其基因环境为位于上游的整合子1(intl1),β-内酰胺类耐药基因blaGES?1,氨基糖苷类/氟喹诺酮类耐药基因aac(6′)?Ⅰb3,氨基糖苷类耐药基因aph(3′)?XV及位于下游的插入序列ISPa21e.该菌包含有357个毒力基因,为exoU+/exoS-基因型.结论 本菌为全球流行的高风险克隆ST235,exoU+/exoS-基因型.全基因组测序分析提供了blaGES?1基因环境、基因分型、耐药基因、毒力基因等多种信息.