侵染昆明园林植物的4个HCRV分离株核壳体蛋白氨基酸序列分析

• 作者: 王宇琪 吴保为 陶宏征 贾志强 高雪 王景文 刘雅婷
• 来源期刊: 云南农业大学学报（自然科学）
• 关键词: 朱顶红褪绿环斑病毒 核壳体蛋白 序列分析
• 年，卷（期）: 2021,（1）
• 所属期刊栏目: 简报|Research Notes
• 页码范围: 165-168
• 页数: 4页
• 分类号: S436.412.11
• 语种: 中文
• DOI: 10.12101/j.issn.1004-390X(n).201903068

摘要

[目的]比较分析侵染昆明园林植物HCRV核壳体蛋白氨基酸序列,探究地理分布和寄主来源与病毒变异的相关性.[方法]2016年,在云南省昆明市园林景区采集疑似感染番茄斑萎病毒属(Tospovirus)病毒样品,利用 RT-PCR技术测定出葱莲(Zephyranthes candida)、文殊兰(Crinum asiaticum)、喜林芋(Philodendron schott)和酢浆草(Oxalis corniculata)4份感染朱顶红褪绿环斑病毒(Hippeastrum chlorotic ringspot virus,HCRV)的样品,通过克隆、测序获得4份样品的S RNA序列,利用ORF Finder获得核壳体蛋白(nucleocapsid protein,N)并进行序列分析.[结果]文殊兰、喜林芋和酢浆草是首次报道的HCRV新寄主;4个HCRV分离物的N蛋白与NCBI首次报道的HLS1-2N蛋白(登录号:AFX74694)一致性达到99.34％;系统进化树分析显示:4个HCRV分离物与GenBank公布的同样来自云南的株系聚为1支.[结论]病毒的地理分布相关性强于寄主相关性.