白刺14-3-3基因家族的鉴定及表达分析

• 作者: 易丹 王博 段慧荣 李毅 王丽蓉
• 来源期刊: 草地学报
• 关键词: 14-3-3基因家族 白刺 生物信息学 表达模式
• 年，卷（期）: 2021,（3）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 443-456
• 页数: 14页
• 分类号: S722.3+6
• 语种: 中文
• DOI: 10.11733/j.issn.1007-0435.2021.03.004

摘要

为探明白刺(Nitraria tangutorum)14-3-3基因家族的基本特征及其进化关系,本研究基于白刺转录组数据,利用生物信息学方法,对白刺14-3-3基因家族成员进行鉴定,预测其理化性质、亚细胞定位、保守结构域,分析其系统进化关系及其基因在不同浓度盐、干旱处理下的组织器官表达模式.结果表明:从白刺转录组数据中初步筛选出10个14-3-3家族成员,其中具有完整蛋白质编码区(Coding Sequence,CDS)的9个成员,其蛋白的编码氨基酸的数目为212～297个,等电点在4.73～6.14之间,分子量范围是24.06～33.51 kDa,二级结构主要以α螺旋为主,三级结构高度保守;亚细胞定位预测显示该家族成员主要分布在细胞质上;表达模式分析表明,14-3-3基因在白刺不同组织器官中呈现不同的表达规律,且参与应答外界的干旱和盐胁迫.由此推测,14-3-3基因家族可能在白刺的胁迫防御方面发挥重要功能.本研究结果为进一步深入揭示白刺14-3-3基因家族的功能奠定基础.