基于基因组序列的脑膜炎奈瑟菌分型方法

• 作者: 袁梦 张雯 胡鹏威 俞慕华 陈辉 徐丽 高源 朱兵清 段永翔 邵祝军
• 来源期刊: 微生物学报
• 关键词: 脑膜炎奈瑟菌 核心基因SNP分型 cgMLST MLST
• 年，卷（期）: 2021,（7）
• 所属期刊栏目: 研究报告|RESEARCH ARTICLES
• 页码范围: 1910-1919
• 页数: 10页
• 语种: 中文
• DOI: 10.13343/j.cnki.wsxb.20200376

摘要

[目的]建立并评估1种适宜的脑膜炎奈瑟菌(Neisseria meningitidis,Nm)基因组分子分型方法.[方法]本研究以125株代表性Nm菌株的基因组序列为对象,建立了基于核心基因SNP的基因组分型方法,并与pubMLST网站公布的MLST和cgMLST分型方法进行比较.[结果]基于核心基因SNP的基因组分型方法和cgMLST方法对125株Nm菌株的分型结果一致性较高,两种方法均明显优于MLST分型方法.基于SNP的基因组分型方法在认识Nm菌的种群结构、界定克隆群方面具有优势;cgMLST分型方法能够对任一菌株进行分型,但不能进行克隆群的界定和归类.[结论]基于核心基因SNP的基因组分型方法和cgMLST均明显优于MLST分型方法,未来仍有待进一步整合和提高.