大鼠肝再生中环状RNA的表达变化及其对细胞增殖的调节作用

• 作者: 郭学强 郭建林 靳伟 常翠芳 徐存拴 陈广文
• 来源期刊: 解剖学报
• 关键词: 肝再生 细胞增殖 竞争性内源RNA网络 环状RNA 生物高通量检测 大鼠
• 年，卷（期）: 2021,（2）
• 所属期刊栏目: 细胞和分子生物学|Cell and Molecules Biology
• 页码范围: 216-224
• 页数: 9页
• 分类号: Q954
• 语种: 中文
• DOI: 10.16098/j.issn.0529-1356.2021.02.009

摘要

目的 探讨环状RNA(circRNA)在大鼠肝再生中的表达变化及其对细胞增殖的调节作用.方法 用生物高通量检测方法分析114只2/3肝切除大鼠诱导的大鼠肝再生中circRNA的表达变化,用miRanda和TargetScan网站分析大鼠肝再生的靶微小RNA(miRNA)及其mRNA,用基因本体论(GO)和IPA软件分析大鼠肝再生涉及的生理活动和信号通路,用Cytoscape v3.0.2软件构建大鼠肝再生的相互作用网络,用表达模式结合靶miRNA数量和功能挑选候选关键circRNA.结果 在大鼠再生肝材料中检测到20 878个circRNA,其中,560个发生差异表达,它们中的126个能与117个靶miRNA结合,后者调节6510个下游靶mRNA.这些靶mRNA涉及细胞增殖、应激反应、物质代谢等生理活动和转化生长因子β(TGF-β)、蛋白激酶A(PKA)、Wnt/β-连环蛋白(β-catenin)等信号通路.其中,circRNA _03651、circRNA_03653、circRNA_04500、circRNA_05865、circRNA_11274、circRNA_13559等6种circRNA可能通过12种miRNA调节15种mRNA进而在大鼠肝再生涉及的细胞增殖中发挥作用,视为大鼠肝再生的候选关键circRNA.结论 大鼠肝再生中560个circRNA发生差异表达,其中circRNA_03651、circRNA_03653、circRNA_04500、circRNA_05865、circRNA_11274、circRNA_13559等6种circRNA通过12种miRNA和15种mRNA的相互作用网络支配大鼠肝再生涉及的细胞增殖.