阴虚体质中lnc RNA和mRNA表达谱分析及调控网络研究

• 作者: 董丽丹 李玲孺 李博怿 严云 郑燕飞 王琦
• 来源期刊: 世界中医药
• 学科: 医学
• 关键词: 长链非编码RNA 阴虚体质 生物信息学 中医
• 年，卷（期）: 2021,（1）
• 所属期刊栏目: 临床研究
• 页码范围: 148-154,159
• 页数: 8页
• 分类号: R21
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1673-7202.2021.01.024

摘要

目的:体质在疾病的形成、发展和转归中起着重要作用.本研究从转录组学水平首次初步揭示阴虚体质者外周血中lncRNA和mRNA的表达谱及相关作用网络.方法:运用Agilent Human lncRNA+mRNA(4×180 k)表达谱芯片,从阴虚体质(n=10)和平和体质(n=9)者的外周血中分离单个核细胞(PBMCs),采用"limma"方法筛选2组的差异基因,然后对其进行GO功能和IPA通路的显著性富集分析,并寻找lncRNA近距离调控的靶基因.结果:差异表达的lncRNAs和mRNAs均能够将阴虚体质和平和体质进行区分.阴虚体质中有显著差异表达的lncRNAs 829个(282个上调,547个下调)和mRNAs 1435个(1038个上调,397个下调).GO功能富集和IPA作用通路结果提示,这些差异表达基因主要与免疫调节、代谢紊乱和信号传导失常通路显著相关.例如,T细胞受体信号转导,NF-κB信号通路,L-arabinose代谢过程和I型糖尿病信号传导等.确定了7个lncRNA-mRNA相互作用对,比如,LTA-HCP5、ORAI3-AC135048.13和BCL7C-AC135048.13等.结论:阴虚体质易感干眼症、高血压、糖尿病等疾病的物质基础可能与lncRNAs/mRNAs的免疫调节、代谢作用和信号传导失常相关.