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摘要:
目的挖掘分析高血压的关键基因,为阐明高血压的发病机制提供生物信息学支持. 方法从GEO数据库下载GSE 74144数据进行差异表达基因(DEG)分析,并使用WGCNA包筛选高血压临床特征相关的模块和基因,而后用ClusterProfiler进行基因功能的注释富集分析.将DEG与WGCNA中的性状模块基因取交集,获取关键基因,并对其进行相关性分析.?结果共筛选出79个DEGs,主要与氧化磷酸化、线粒体内膜蛋白复合物形成和呼吸小体形成等有关.获得1个与高血压高度相关的模块,主要参与血小板活化、局部粘附、RAP1信号通路等,并获取12个关键基因FAM69B、FLJ44511、EPB49、CDKN2A、ND2、OST4、HIST1H2BI、ODF3L2、SPARC、MMD、TMEM140和DDX11L2.?结论通过WGCNA获得与高血压高度相关的模块和12个关键基因,为更深入地探索高血压发生发展机制提供理论依据.
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文献信息
篇名 基于加权基因共表达网络分析高血压的关键基因
来源期刊 心脑血管病防治 学科
关键词 高血压 加权基因共表达网络 关键基因
年,卷(期) 2021,(3) 所属期刊栏目 临床研究|Clinical Research
研究方向 页码范围 254-257
页数 4页 分类号
字数 语种 中文
DOI 10.3969/j.issn.1009-816x.2021.03.012
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高血压
加权基因共表达网络
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心脑血管病防治
双月刊
1009-816X
33-1252/R
大16开
杭州市灵隐路12号浙江医院5号楼
2001
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