人工养殖西伯利亚狍肠道微生物组成的雌雄差异

• 作者: 刘金月 刘德凯 王璐瑶 李响 贾博文 刘艳华
• 来源期刊: 野生动物学报
• 关键词: 狍 肠道微生物 性别 Alpha多样性 Beta多样性
• 年，卷（期）: 2021,（2）
• 所属期刊栏目: 研究论文|ORIGINAL PAPERS
• 页码范围: 428-436
• 页数: 8页
• 分类号: Q93
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-0127.2021.02.015

摘要

肠道微生物是一个复杂的生态系统,与宿主的健康、疾病以及其他因素有着密切的关系.目前,关于肠道菌群结构和功能的研究较多,但是对西伯利亚狍肠道菌群的研究还未见报道.西伯利亚狍(Capreolus pygargus)属于反刍动物,有独特的消化特性和微生物群来帮助它们适应高纤维的食物.本研究利用高通量测序技术在Illumina MiSeq平台上对14只狍肠道微生物进行16S rRNA基因分析.结果表明:个体样本中门类组成的差异,雌性个体JY3和雄性个体JY9除Firmicutes,Bacteroidetes,Proteobacteria这3类菌群外,其他门类菌群所占比例都很低.在科水平上,雌性个体中Ruminococcaceae在JY7和JY13肠道内含量相对较少,Bacteroidaceae在JY7,JY10和JY13中含量较高.雄性个体中Ruminococcaceae在JY11和JY14肠道内含量较少,Prevotellaceae在JY4中含量较少.在属水平上,雌性个体特有的菌属为Roseburia,Alloprevotella,Lachnospiraceae_incer-tae_sedis和Coprococcus;雄性个体特有的菌属为Fusobacterium,Succiniclasticum,Strepto-coccus和Clostridium sensu stricto.Alpha多样性分析表明,Ace指数范围2128.93—772.98,Chao1指数范围2128.89—785.27,Shannon指数范围5.44—3.78,Simpson指数范围0.07—0.01.在不同物种分类水平上,雌雄狍肠道内的优势菌群有些不同.PCoA(principal co-ordinates analysis)分析显示,狍样本几乎混在一起,没有明显差异.