郑州市某三甲医院耐碳青霉烯类抗生素肺炎克雷伯菌的基因组分型分析

• 作者: 徐慧 周海健 李晓改 杜小莉 胡锦瑞 陈东科 崔志刚
• 来源期刊: 中华预防医学杂志
• 关键词: 克雷伯菌， 肺炎 基因组， 细菌 医院 碳青霉烯类抗生素 全基因组测序
• 年，卷（期）: 2021,（4）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 512-516
• 页数: 5页
• 语种: 中文
• DOI: 10.3760/cma.j.cn112150-20210218-00152

摘要

目的:分析郑州市某三甲医院耐碳青霉烯类抗生素肺炎克雷伯菌（CRKP）的基因组分型特征。方法:于2019年12月4日至2020年1月10日，自郑州市某三甲教学医院各临床科室送检且开展微生物检测的标本中分离出67株CRKP菌株。通过将全基因组测序和序列分析，确定多位点序列分型（MLST）型别（ST）和碳青霉烯类抗生素耐药基因。基于全基因组SNP构建进化树将67株CRKP划分克隆群，并且分析各克隆群的分离病房和分离日期。结果:67株CRKP分为4种ST型，其中64株为ST11型。ST11型菌株中有62株携带 blaKPC-2基因。基于全基因组水平的SNP构建进化树，将64株ST11型菌株分为4个克隆群，其中2个克隆群为优势克隆群，分别包含33株和27株菌；另外2个克隆群分别只包含2株菌。优势克隆群在分离病区和分离日期上均没有聚集性。 结论:携带 blaKPC-2基因的ST11型菌株已分化出多个克隆群，且可在同一家医院存在多个克隆群菌株的平行、独立流行。