黄鳍棘鲷线粒体D-loop序列的遗传结构

• 作者: 何震晗 肖珊 王韶韶 陈慧芳 苏绍萍 赵永贞 杨春玲 曾地刚 朱威霖 陈秀荔 马华威 蒋伟明 刘青云 李强勇 彭敏
• 来源期刊: 水产学报
• 关键词: 黄鳍棘鲷 D-loop序列 遗传多样性 遗传分化
• 年，卷（期）: 2021,（3）
• 页码范围: 345-356
• 页数: 12页
• 分类号: Q785|S917.4
• 语种: 中文
• DOI: 10.11964/jfc.20191212113

摘要

为探明分布于我国华南沿海的黄鳍棘鲷群体的遗传多样性与遗传分化状况,实验采用线粒体控制区(D-loop)基因序列分析华南沿海的厦门、汕尾、阳江、海口、三亚、北海、钦州和防城港8个地理位置的黄鳍棘鲷群体的遗传多样性及群体遗传结构.结果 显示,黄鳍棘鲷8个群体320条D-loop序列全长为947～958bp.共检测到29个插入或缺失位点和210个变异位点,其中简约信息位点142个,单一变异位点68个;总体的变异位点、单倍型数、单倍型多样性(Hd)、平均核苷酸差异和核苷酸多样性(π)分别为210、268、0.998 43、14.790 65和0.015 70.聚类分析结果显示,8个群体被聚类为以琼州海峡分隔的东和西两个组群;8个群体间的遗传分化系数(FST)为-0.012 68～0.466 74,基因流(Nm)为0.571 26～∞.方差分析显示组群间、组群内群体间和群体内个体间的核苷酸遗传变异分别为33.42％、0.32％和66.26％.中性检验显示Tajima's D为-1.694 77,Fu's Fs为-23.683 39,表明华南沿海黄鳍棘鲷经历了种群扩张事件.研究表明,中国华南沿海黄鳍棘鲷群体遗传多样性比较丰富,根据研究结果可以以琼州海峡为分界分为东组群和西组群2个管理单位进行种质保护.