大豆GmNCED5基因非生物胁迫响应及生物信息学分析

• 作者: 朱琨 翟莹 于海伟 张军 邱爽 何佳琦 李铭杨
• 来源期刊: 大豆科学
• 关键词: 大豆 GmNCED5 非生物胁迫 表达分析 生物信息学分析 顺式作用元件
• 年，卷（期）: 2021,（4）
• 所属期刊栏目: 遗传育种·分子生物学|Genetic & Breeding·Molecular Biology
• 页码范围: 476-481,489
• 页数: 7页
• 语种: 中文
• DOI: 10.11861/j.issn.1000-9841.2021.04.0476

摘要

为探究大豆9-顺式-环氧类胡萝卜素双加氧酶(NCED)基因GmNCED5对非生物胁迫的响应及原理,为植物基因工程及大豆抗逆育种提供理论基础,本研究检测GmNCED5在非生物胁迫下的表达量,并对该基因及其启动子序列进行生物信息学分析.实时荧光定量PCR结果显示,干旱、高盐、高温、低温及外源脱落酸(ABA)处理均可以不同程度地诱导GmNCED5在大豆幼苗中表达.GmNCED5基因开放阅读框(ORF)全长1 686 bp,编码561个氨基酸.亚细胞定位预测结果显示,GmNCED5蛋白主要定位于细胞质中.系统进化分析表明GmNCED5蛋白与豇豆VuNCED蛋白的亲缘关系最近.启动子预测分析结果显示,GmNCED5启动子区域含有5种激素响应相关顺式作用元件和3种胁迫响应相关顺式作用元件.由此推测GmNCED5可能通过启动子区域的顺式作用元件响应非生物胁迫.