癫痫大鼠海马组织的转录组学特征分析

• 作者: 黄亚辉 匡卫平 朱勇 王琴 卢军 张熙 贺冰 杨萍
• 来源期刊: 国际神经病学神经外科学杂志
• 关键词: 癫痫 慢性自发性癫痫 转录组测序 信使RNA 微小RNA 大鼠
• 年，卷（期）: 2021,（3）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 249-255
• 页数: 7页
• 分类号: R742.1
• 语种: 中文
• DOI: 10.16636/j.cnki.jinn.1673-2642.2021.03.008

摘要

目的 探究癫痫的转录组学特征,寻找癫痫诊治的潜在靶点.方法 选取雄性幼龄SD大鼠17只,采用抽签法随机将大鼠分为2组:对照组(8只)、CSRS组(9只).基于氯化锂-匹罗卡品构建的慢性自发性癫痫(CSRS)大鼠模型,取CSRS大鼠及对照组大鼠海马组织进行转录组测序(RNA-seq),并对信使RNA(mRNA)及微小RNA(miRNA)进行差异分析、信号通路富集分析及差异表达蛋白互作用网络构建寻找核心调控基因.结果 对照组及CSRS组的mRNA进行差异分析获得的354个差异表达基因(DEGs),信号通路富集分析DEGs与离子转运调控、组织发育、应激反应等相关.蛋白互作网络分析发现WDR88、SHANK2、TEC、NFKBIZ、EPHA8等为DEGs中主要的核心调控基因.同时获得差异表达miRNA,并进行靶基因预测及GO通路富集分析,发现靶基因主要与离子型谷氨酸受体复合物、谷氨酸受体活性、谷氨酸盐化的钙离子通道活性、NF-κB诱导激酶活性等分子功能相关.结论 基于RNA-seq发现差异基因表达异常是癫痫发生的重要原因,是导致神经元发生异常的、同步化放电的关键因素.