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泪腺腺样囊性癌高级别转化的蛋白组学分析
泪腺腺样囊性癌高级别转化的蛋白组学分析
作者:
姜美霞
刘勋
朱利民
何彦津
王婷婷
张传丽
林婷婷
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
癌,腺样囊性
眼肿瘤
泪器疾病
细胞转化,肿瘤
蛋白质组学
摘要:
目的:分析泪腺腺样囊腺癌(LACC)高级别转化(HGT)的蛋白表达差异。方法:实验研究。收集2012年12月至2019年1月在天津医科大学眼科医院就诊的8例LACC患者的石蜡组织样本。根据组织病理学检查结果,分为LACC组和LACC-HGT组,每组4例,男性和女性各2例;平均年龄分别为53、44岁。采用同位素相对标记与绝对定量技术筛选两组石蜡组织样本的差异蛋白,对差异蛋白进行生物信息学分析。运用新鲜组织块培养法进行原代细胞培养,运用基因芯片筛选LACC与LACC-HGT原代细胞之间差异表达的mRNA。将质谱数据与mRNA芯片数据取交集,并进行实时荧光定量PCR验证。蛋白组学和基因芯片数据的比较采用独立样本 t检验;PCR数据比较采用单因素方差分析。 结果:共检测到HGT相关差异蛋白105个,包括50个上调蛋白和55个下调蛋白。显著上调的蛋白有血红蛋白、糖化血红蛋白和Ⅵ型胶原蛋白2等;显著下调的蛋白有Cereblon蛋白、S-腺苷同型半胱氨酸水解酶样蛋白2和核糖体蛋白L39等。基因本体分析结果表明,LACC-HGT差异蛋白主要定位于细胞质、囊泡腔、细胞外基质,具有有机酸结合、分子载体活性等,参与调控细胞外基质组成、免疫、炎性反应及凋亡等生物学过程。通路富集分析显示,LACC-HGT差异蛋白主要参与丝裂原活化蛋白激酶、细胞外基质-蛋白聚糖及聚糖代谢等信号通路。蛋白复合体预测分析筛选出4个上调的蛋白复合体和1个下调的蛋白复合体。LACC-HGT差异蛋白与mRNA芯片差异基因重合的共15个,其中肿瘤相关蛋白6个包括 型胶原蛋白1 (COL14A1)、棘皮微管相关蛋白4(EML4)、α-胰蛋白酶抑制因子(ITIH4)、N-myc下游调控基因2 (NDRG2)、骨诱导因子(OGN)、RAS同源基因家族C(RhoC)。主要功能涉及肿瘤细胞的运动和迁移等。PCR结果表明,COL14A1、EML4、ITIH4、NDRG2、OGN、RhoC在LACC-1、LACC-2、LACC-HGT-1和LACC-HGT-2原代细胞中的相对表达量差异有统计学意义( F=1 675.98,38.53,27.37,16.47,13.38,25.22;均 P<0.01),如COL14A1在LACC-HGT-1和LACC-HGT-2原代细胞中的相对表达量(16.09±0.51、9.96±0.34)均显著高于LACC-1原代细胞(1.00±0.13)和LACC-2(0.67±0.08)(均 P<0.05)。 结论:LACC-HGT与LACC之间存在差异表达蛋白,其中COL14A1、EML4、ITIH4、NDRG2、OGN、RhoC可能在LACC的高级别转化过程中具有重要意义,可作为LACC-HGT的潜在靶点进行深入研究。 (中华眼科杂志,2021,57:531-539)
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篇名
泪腺腺样囊性癌高级别转化的蛋白组学分析
来源期刊
中华眼科杂志
学科
关键词
癌,腺样囊性
眼肿瘤
泪器疾病
细胞转化,肿瘤
蛋白质组学
年,卷(期)
2021,(7)
所属期刊栏目
论著
研究方向
页码范围
531-539
页数
9页
分类号
字数
语种
中文
DOI
10.3760/cma.j.cn112142-20200720-00491
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细胞转化,肿瘤
蛋白质组学
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研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
中华眼科杂志
主办单位:
中华医学会
出版周期:
月刊
ISSN:
0412-4081
CN:
11-2142/R
开本:
大16开
出版地:
北京市西城区宣武门东河沿街69号
邮发代号:
2-60
创刊时间:
1950
语种:
chi
出版文献量(篇)
6374
总下载数(次)
33
总被引数(次)
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