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特发性肺动脉高压患者外周血单核细胞差异表达基因分析
特发性肺动脉高压患者外周血单核细胞差异表达基因分析
作者:
郭海森
张炜岱
倪楚民
周琳洁
蔡志雄
朱稚丹
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
肺动脉高压
特发性肺动脉高压
系统性硬化病
单核细胞
生物信息学
摘要:
目的:探究特发性肺动脉高压(IPAH)患者的外周血单核细胞差异表达基因及相关信号通路,为进一步研究和临床诊疗提供新的靶点.方法:通过GEO数据库获取GSE33463基因芯片数据集,筛选特发性肺动脉高压(IPAH,30例)作为研究组,分别与对照组(41例)和系统性硬化病相关肺动脉高压组(SSc?PAH,42例)进行比较分析.采用R软件和GEO2R工具筛选差异表达基因,并进行GO基因本体分析、KEGG信号通路分析和蛋白质相互作用分析.结果:与对照组相比,IPAH组外周血单核细胞共筛选33个上调基因和51个下调基因.上调基因中HBD、NFE2、HBE1、HBG1、EPB42、SELENBP1、AHSP、SNCA、ALAS2、HBG2、HBQ1和HBM共12个基因为枢纽基因,主要参与血红蛋白复合体组成、氧转运蛋白活性调节、氧输送、氧结合等生物学过程.下调基因中JUNB、JUN、NFKBIA和FOSB4为枢纽基因,主要参与AP?1转录因子信号传导、对激素刺激反应等生物学过程.与SSc?PAH组相比,IPAH组共筛选出1个上调基因(RBPMS2)和18个下调基因,下调基因中OAS2、OAS3、IFI6和IFITM3作为枢纽基因参与免疫反应过程.结论:IPAH患者外周血单核细胞的红系基因表达上调和AP?1信号传导下调可能在IPAH的发生发展过程中发挥重要作用,可以作为进一步临床研究的方向.OAS2、OAS3、IFI6和IFITM3基因可能有助于IPAH与SSc相关肺动脉高压的鉴别诊断.
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特发性肺动脉高压患者外周血单核细胞差异表达基因分析
来源期刊
广州医科大学学报
学科
关键词
肺动脉高压
特发性肺动脉高压
系统性硬化病
单核细胞
生物信息学
年,卷(期)
2021,(4)
所属期刊栏目
临床研究
研究方向
页码范围
33-38
页数
6页
分类号
R543.2
字数
语种
中文
DOI
10.3969/j.issn.2095-9664.2021.04.06
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主办单位:
广州医科大学
出版周期:
双月刊
ISSN:
2095-9664
CN:
44-1710/R
开本:
16开
出版地:
广州市东风西路195号
邮发代号:
创刊时间:
1973
语种:
chi
出版文献量(篇)
3818
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