利用在线数据库分析乳腺癌中程序性死亡蛋白-1相关信号通路基因的临床意义

• 作者: 陈路 李习平 胡爽 戴周彤 何晓宏 王志文
• 来源期刊: 生命科学研究
• 学科: 医学
• 关键词: 程序性死亡蛋白-1 (PD-1) 程序性死亡蛋白配体-1(PD-L1) 免疫治疗 乳腺癌
• 年，卷（期）: 2021,（6）
• 所属期刊栏目: 生物信息学|BIOINFORMATICS
• 页码范围: 548-556,564
• 页数: 10页
• 分类号: Q811.4|R737.9
• 语种: 中文
• DOI: 10.16605/j.cnki.1007-7847.2020.04.0170

摘要

针对程序性死亡蛋白-1 (programmed death-1,PD-1)的免疫疗法在乳腺癌中获得了显著成功.但是,并非所有患者都能从抗体治疗中受益.为了鉴定PD-1信号通路相关基因的表达及在乳腺癌中作为预后标志物的潜力,本文通过Oncomine、GTEx数据库和癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库挖掘了PD-1信号通路相关基因的表达特征及预后作用,并且使用STRING数据库对其蛋白质-蛋白质相互作用网络进行了预测.结果 显示,PD-1信号通路相关基因的表达在不同的癌症中表现出显著差异.在乳腺癌中,PD-1信号通路相关基因的表达水平显著高于正常组织,并且其表达情况与乳腺癌患者的分期及年龄无关.将乳腺癌患者按照PD-1和程序性死亡蛋白配体-1(programmed death ligand-1,PD-L1)表达的中位值分为高表达组与低表达组,高表达组显示出更好的总体生存率.此外,蛋白质-蛋白质相互作用网络预测结果显示,PD-1与非受体型蛋白质酪氨酸磷酸酶(protein tyrosine phosphatase non-receptor,PTPN)家族的表达高度相关.综上所述,本研究为开展新的基于PD-1的免疫疗法提供了理论支持.