9-CpG年龄推断在不同海拔地域和性别人群中的验证及优化

• 作者: 孙晓萌 刘雅洁 李姗飞 李彩霞 丰蕾
• 来源期刊: 中国法医学杂志
• 关键词: DNA甲基化 年龄预测 性别 高原
• 年，卷（期）: 2021,（3）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 274-279
• 页数: 6页
• 分类号: DF795.1
• 语种: 中文
• DOI: 10.13618/j.issn.1001-5728.2021.03.011

摘要

目的 本研究旨在对早先建立的9-CpG年龄推断模型在不同海拔地域和不同性别人群中年龄推断的适用性进行验证及优化,提升年龄推断的准确性,并研究检测体系的灵敏度.方法 采集367份不同海拔地域、不同性别个体的血液样本,使用EpiTYPER技术平台检测9个CpG位点的甲基化值,利用年龄推断模型预测样本提供者的年龄,综合评估年龄预测的准确性.结果 所有测试样本均获得相对准确的年龄预测值(N=367,MAD=4.0岁,R2=0.83).平原女性样本(N=40),MAD=3.63岁,R2=0.88.平原男性样本(N=123)MAD=3.42岁,R2=0.83;其中随机选取平原男性样本(N=40)MAD=3.39岁,R2=0.83;高原男性样本(N=204)MAD=4.42岁,R2=0.86.加入平原与高原变量,新建立8-CpG年龄推断模型,MAD=2.90岁,R2=0.86(验证集MAD=3.31岁,R2=0.83).灵敏度分析中转化前最低DNA用量为250ng(转化后最低DNA用量约为8ng)可获得9个位点完整甲基化信息.结论 本研究证明了9-CpG年龄推断模型在不同性别间无显著差异.同一模型应该考虑高原和平原人群血液样本DNA甲基化差异.加入平原与高原变量,新建立8-CpG年龄推断模型可提高高原地区人群年龄预测准确性.