自噬相关基因在急性髓系白血病中的预后意义

• 作者: 张雪宁 薛曼婕 许珏琼 赖文兴
• 来源期刊: 热带医学杂志
• 关键词: 自噬 急性髓系白血病 预后 基因 生物信息学
• 年，卷（期）: 2021,（2）
• 所属期刊栏目: 硕博专栏论著|Basic Research
• 页码范围: 144-147,0
• 页数: 5页
• 分类号: R733.71
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1672-3619.2021.02.005

摘要

目的 基于生物信息学方法,研究自噬相关基因在急性髓系白血病(AML)中的预后意义.方法 根据从The Cancer Genome Atlas (TCGA)数据库下载AML的RNA-seq数据和临床数据,基于自噬基因的表达谱,使用单因素Cox回归分析确定与AML的总生存期(OS)显著相关的自噬相关基因;使用LASSO回归分析建立自噬相关基因的预后预测模型;使用Kaplan-Meier生存分析进行预后模型的验证;GO、KEGG和蛋白质-蛋白质分析揭示与AML中15个风险基因相关的信号传导途径、细胞过程和蛋白质互作关系.结果 自噬相关基因的批量单因素Cox回归分析,共有34个自噬相关基因和AML患者的OS存在显著相关(P＜0.05),其中有15个被视为风险基因,19个被视为保护基因;检验自噬相关基因的预后预测模型,其ROC曲线下面积(AUC)为0.74,显示该预测模型具有准确性及可靠性;根据预测模型的中位风险评分分组,AML高风险组的风险基因表达高于低风险组;Kaplan-Meier生存分析表明高风险组的总体生存较低风险组更差;风险评分与生存时间的关系呈现负相关;GO和KEGG分析提示自噬相关基因的生物学过程可能涉及细胞分化的负向调控、囊泡产生以及RAGE受体结合等;并且基因间的蛋白互作存在紧密联系.结论 基于自噬基因的预测模型可用于AML的预后评估.