基于生信数据库探析NAT1基因在结肠癌中的表达及临床意义

• 作者: 李丹 余涛 曾智 吴杰 兰昱 宋伟
• 来源期刊: 生物技术
• 学科: 医学
• 关键词: 结肠癌 NAT1基因 TCGA数据库 Oncomine数据库 生物信息学分析
• 年，卷（期）: 2021,（5）
• 所属期刊栏目: 技术与方法|Technique and Method
• 页码范围: 458-464,507
• 页数: 8页
• 分类号: R735.3
• 语种: 中文
• DOI: 10.16519/j.cnki.1004-311x.2021.05.0069

摘要

[目的]通过大数据分析了解NAT1mRNA和蛋白质在结肠癌中的表达情况及对临床预后的影响.[方法]检索当前世界上几个主要的肿瘤生物信息数据库(Oncomine、TCGA、CPTAC等)中有关NAT1的相关数据,对其进行生物信息学分析,对NAT1在结肠癌中的临床作用进行荟萃分析.[结果]443项有关NAT1的不同类型研究结果纳入Onco-mine数据库,NAT1表达在肿瘤与其对照组织中有统计学差异的结果有37项,其中NAT1高表达的有12项,低表达的有25项.涉及到结肠癌的研究共有15项,且在结肠癌组织中均为低表达.涉及到NAT1在结肠癌和正常组织中的mRNA表达的样本共有565例.Oncomine数据库中9项研究数据集的二次分析结果表明NAT1在结肠癌中的表达低于正常组织(P＜0.05).TCGA数据库和CPTAC数据库提示NAT1在结肠癌中的mRNA和蛋白水平均呈现低表达(P＜0.05).另外,免疫组织化学显示NAT1在结肠癌组织中表达较弱或呈阴性,而在正常组织中表达较强或中等.NAT1表达和年龄、种族、性别、体重、肿瘤分期无关,而与肿瘤的组织病理分型可能存在一定相关性(P＜0.05).不仅如此,生存分析发现高表达NAT1的患者预后较好(P＜0.05).[结论]NAT1的mRNA和蛋白水平在结肠癌组织中呈现低表达,和结肠癌不良预后相关.