钝裂银莲花花色素合成相关基因qRT-PCR内参基因的筛选

• 作者: 马璐琳 段青 崔光芬 杜文文 贾文杰 王祥宁 王继华 陈发棣
• 来源期刊: 园艺学报
• 关键词: 钝裂银莲花 实时荧光定量PCR 内参基因 筛选 稳定性 类黄酮/花青素合成途径
• 年，卷（期）: 2021,（2）
• 所属期刊栏目: 研究报告|Research Notes
• 页码范围: 377-388
• 页数: 12页
• 分类号: S682
• 语种: 中文
• DOI: 10.16420/j.issn.0513-353x.2020-0306

摘要

为了筛选适合于钝裂银莲花类黄酮/花青素合成途径中相关基因qRT-PCR表达分析时的内参基因,根据钝裂银莲花蓝/白不同花色花器官组织的转录组测序结果,选取了多聚泛素酶基因(polyubiquitin,UBQ)、微管蛋白基因(β-tubulin,-TUB)、水通道蛋白基因(aquaporin,AQP)、肌动蛋白基因(actin,ACT)、甘油醛-3-磷酸-脱氢酶基因(glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase,GAPDH)、组蛋白基因(histone,HIS)、转录延伸因子基因(elongation factor 1-β,EF-1β)和60S核糖体蛋白基因(60S ribosomal protein L13-1,RPL13)等8个常用内参基因作为候选基因,以钝裂银莲花的叶片、茎杆和蓝/白色花器官等不同组织为试验材料,通过qRT-PCR检测这8个候选内参基因的表达情况,利用geNorm、NormFinder和BestKeeper等软件对其稳定性进行分析评价.结果 表明:8个候选内参基因中,UBQ表现最稳定,而β-TUB相对稳定性最差.以最稳定的UBQ为内参对钝裂银莲花类黄酮/花青素合成途径中16个相关基因表达情况进行qRT-PCR分析,结果与前期转录组测序结果一致.UBQ为钝裂银莲花花色素合成途径相关基因表达分析的最适内参基因.