大鼠肝再生中环状RNA表达谱的变化及其对自噬的影响

• 作者: 王棋文 姚奋杰 杨卓菲 郭学强 穆萌萌 周运 徐存拴
• 来源期刊: 解剖学报
• 关键词: 自噬 肝再生 高通量测序 大鼠
• 年，卷（期）: 2021,（4）
• 所属期刊栏目: 细胞和分子生物学|Cell and Molecules Biology
• 页码范围: 581-588
• 页数: 8页
• 分类号: Q954
• 语种: 中文
• DOI: 10.16098/j.issn.0529-1356.2021.04.013

摘要

目的 探讨大鼠肝再生中环状RNA(circRNA)的表达变化以及对自噬的影响.方法 以60只大鼠2/3肝切除0 h、2 h、6 h、12 h、24 h、30 h、36 h、72 h、120 h 和 168 h 后的再生肝 circRNAs、微小 RNAs(miRNAs)、mRNA的高通量测序数据为基础,分析其在肝再生中的表达变化,进一步用miRanda aug 2010软件预测circRNA-miRNA和miRNA-mRNA靶标关系,并根据基因功能→miRNA功能→circRNA功能反向推测得到支配大鼠肝脏自噬的肝再生相关circRNAs和miRNAs,并构建它们的相互作用网络.结果 与肝再生自噬相关的circRNAs、miRNAs、mRNA分别有102、42、153种.利用生物信息学分析,发现44种circRNAs、13种miRNAs及17种mRNA之间有相互作用关系,并以此构建了它们的共表达网络.结论 筛选出了与肝再生自噬相关的circRNAs、miRNAs和mRNA,并构建了相互作用网络图谱.