老鸦瓣芽茎发育相关MYB转录因子家族鉴定与分析

• 作者: 张军霞 郭巧生 朱再标 徐碧霞
• 来源期刊: 中草药
• 关键词: 转录组 功能注释 进化分析 表达分析 实时荧光定量PCR
• 年，卷（期）: 2021,（6）
• 所属期刊栏目: 药材与资源|Medicinal Materials
• 页码范围: 1735-1743
• 页数: 9页
• 分类号: R286.12
• 语种: 中文
• DOI: 10.7501/j.issn.0253-2670.2021.06.023

摘要

目的 鉴定老鸦瓣Amana edulis MYB转录因子家族成员并分析其表达模式,以期发现老鸦瓣芽茎发育相关MYB基因.方法 利用老鸦瓣转录组数据经Pfam和PlnTFDB数据库鉴定含有MYB保守结构域的MYB转录因子,通过构建系统进化树并根据拟南芥MYB分组信息为老鸦瓣R2R3-MYB基因划分亚组,进行2R-MYB结构域可视化分析和GO富集分析,挑选在芽茎中特异表达的MYB基因并用实时荧光定量PCR (qRT-PCR)验证表达.结果 共鉴定出93个含有MYB保守结构域的MYB转录因子,其中53个R2R3-MYB分为15个亚组,GO注释为生物过程的子类别最多,在芽茎中特异表达的12个MYB基因中有1 1个基因在芽茎发育前期至中期的表达量显著下降,有4个基因在芽茎发育中期至后期的表达量显著上升.结论 获得的53个R2R3-MYB转录因子为进一步研究老鸦瓣MYB转录因子家族影响芽茎发育过程的分子机制奠定了基础.