不同生境草鱼肠道微生物组成和群落特征分析

• 作者: 丁红秀 李忠莹 刘俊 沙小梅 张露 涂宗财
• 来源期刊: 微生物学报
• 关键词: 草鱼 生境 肠道微生物 高通量测序
• 年，卷（期）: 2021,（3）
• 所属期刊栏目: 研究报告|RESEARCH ARTICLES
• 页码范围: 729-739
• 页数: 11页
• 语种: 中文
• DOI: 10.13343/j.cnki.wsxb.20200439

摘要

[目的]分析不同生境来源的草鱼前肠、中肠和后肠的微生物组成和群落特征.[方法]利用16S rRNA高通量测序技术比较河流、湖泊、高密度池塘养殖与水库低密度养殖4种不同生境来源的草鱼其前、中、后肠的微生物组成和群落特征.[结果]Venn图、稀释性曲线和Alpha指数分析结果显示,前肠微生物群落多样性以养殖生境草鱼更高,而后肠微生物群落多样性以自然生境草鱼更高.不同生境草鱼前肠微生物组成和群落特征差异较大,自然生境的草鱼前肠微生物优势菌群都是不动杆菌属和贪铜菌属;高密度池塘养殖生境优势菌群是鲸杆菌属、希瓦氏菌属;低密度水库养殖生境的草鱼前肠优势菌群是链球菌属、消化链球菌属等.[结论]不同生境的环境因子不同,养殖方式不同,饵料不同,导致草鱼前肠微生物组成和群落特征的差异较大,该结果可为草鱼肠道微生物的研究提供基础数据.高密度养殖生境的草鱼存在潜在的感染风险,建议优化养殖模式以减少有害菌的产生.