临床宏基因组学应用现状及存在问题分析

• 作者: 邱薇 钟民涛 伦永志
• 来源期刊: 中国微生态学杂志
• 关键词: 临床微生物学 宏基因组学 传染病诊断 生物信息学
• 年，卷（期）: 2021,（5）
• 所属期刊栏目: 综述|Reviews
• 页码范围: 594-598
• 页数: 5页
• 分类号: R372
• 语种: 中文
• DOI: 10.13381/j.cnki.cjm.202105021

摘要

众所周知,宏基因组学是一种通过提取样品中微生物的总DNA,构建宏基因组文库,研究环境中全部微生物的遗传组成及其菌落功能的方法.而宏基因组新一代测序(metagenome next-generation sequencing,mNGS)是在宏基因组学基础上进一步发展起来的新一代测序技术,无需对患者标本进行培养,直接分析标本中的微生物DNA或RNA.本文介绍了宏基因组学在临床上的应用,包括传染病的诊断、疾病和健康状态下的微生物组分析、人类宿主反应分析和肿瘤相关病毒及其基因组鉴定,并简要探讨了临床宏基因组学研究中所遇到的挑战及解决方法.