松树内生细菌GD2对松材线虫入侵寄主时转录组的影响

• 作者: 陈阳雪 赵晓佳 谈家金
• 来源期刊: 华中农业大学学报
• 关键词: 转录组分析 松材线虫 马尾松内生细菌GD2 差异表达基因 线虫-细菌微生态
• 年，卷（期）: 2021,（5）
• 所属期刊栏目: 植物保护|Plant protection
• 页码范围: 37-45
• 页数: 9页
• 分类号: S763
• 语种: 中文

摘要

为了进一步阐明细菌在松材线虫病中的作用,采用松材线虫(CK)和松材线虫与马尾松内生细菌GD2的混合物(T)分别接种马尾松,对松材线虫进行转录组测序、Gene Ontology(GO)及KEGG富集分析,并利用Real-time Quantitative PCR(RT-qPCR)验证目标基因表达情况.结果显示,与对照组(空白虫)CK相比,共筛选到143个差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs),其中有63个上调基因,80个下调基因.Gene Ontology分析显示,差异表达基因在免疫系统过程、细胞膜、代谢过程、转运活性等功能类富集.KEGG通路在ECM-receptor互作、肾素-血管紧张素、糖酵解、胰岛素信号等通路富集.这些GO功能与KEGG通路涉及机体的免疫调节.选取8个基因进行RT-qPCR验证,表达水平与测序结果一致,证明了测序结果的准确性.表明菌株GD2可以通过提高松材线虫的免疫调节能力来影响松材线虫病的发生.