结直肠癌发生过程中普拉梭菌丰度变化的研究

• 作者: 钟华戈 严林海 陈伊 吴昌淘 唐卫中
• 来源期刊: 广西医科大学学报
• 关键词: 结肠癌 GMrepo 宏基因组测序 普拉梭菌
• 年，卷（期）: 2021,（6）
• 所属期刊栏目: 基础研究
• 页码范围: 1077-1082
• 页数: 6页
• 分类号: R735.35
• 语种: 中文
• DOI: 10.16190/j.cnki.45-1211/r.2021.06.002

摘要

目的:探究基于GMrepo数据库背景下,健康对照、腺瘤患者、腺癌患者肠道菌群多样性改变规律,为肠道菌群与结直肠癌的发生机制研究提实验室证据.方法:GMrepo分析健康对照、腺瘤患者、腺癌患者肠道菌群丰度改变,并筛选出腺瘤癌变过程中丰度变化较大的菌群.收集35例结直肠腺瘤患者粪便,提取DNA进行宏基因组测序,建立文库.用MetaPhlAn与HU-MAnN生信分析软件对菌群丰度进行分析与功能注释.数据处理与统计分析采用宏基因组学分析软件LEfSe7、STAMP8、QI-IME9和R数据包.结果:GMrepo分析健康对照、肠道腺瘤患者、结直肠癌患者98个菌属中有3个菌属存在显著丰度差异,其中包括瘤胃球菌科、双歧杆菌科、梭菌科,其中瘤胃球菌科包括瘤胃球菌科和粪杆菌属.腺瘤到结直肠癌过程中普拉梭菌和双歧杆菌的丰度降低,而牙周梭杆菌的丰度增加.35例腺瘤患者宏基因组学测序结果显示,与健康对照比较,腺瘤患者的菌群丰度发生了显著变化,菌门水平上,放线菌门有显著差异;菌种水平上,普拉梭菌、罗氏弧菌、双歧杆菌、唾液链球菌有明显差异(P＜0.05).结论:普拉梭菌丰度降低,是发生在健康对照—腺瘤患者—腺癌患者全程中的事件,其丰度降低可能与结直肠癌发生相关,并且可能成为结直肠癌发生的一个微生物观察点.