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访花昆虫野蚜蝇线粒体基因组结构分析
访花昆虫野蚜蝇线粒体基因组结构分析
作者:
闫艳
程梦迪
曹春桥
李虎
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
蚜蝇
线粒体基因组
系统发育
摘要:
野蚜蝇Syrphus torvus(Osten-Sacken)成虫具访花习性,是重要的传粉昆虫;幼虫捕食蚜虫,是蚜虫重要天敌之一.本研究通过高通量测序、组装拼接获得了完整的野蚜蝇线粒体基因组全序列(GenBank登录号:MW074962),其序列全长为16 444 bp,包含13个蛋白编码基因(PCGs)、22个tRNAs、2个rRNAs和D-loop区.野蚜蝇线粒体全序列A+T含量为80.6%,G+C含量为19.4%,表现出明显的A+T偏斜.除了 COXI、ATP8、ATP6和ND1的起始密码子为TTG,其它9个PCGs以ATN为起始密码子;COXI的终止密码子为不完整的T--,ATP6为TAG,其余11个PCGs的终止子为TAA.22个tRNAs的二级结构均为典型的三叶草结构,并预测了野蚜蝇rRNAs的二级结构.野蚜蝇D-loop区存在重复序列和茎环结构,22种蚜蝇科基因间隔区与重叠区具有6个保守区域.基于24个物种(22个蚜蝇科和2个缟蝇科)的PCGs序列,通过贝叶斯法(BI)和最大似然法(ML)构建系统发育树,结果显示,野蚜蝇和黑足蚜蝇Syrphus vitripennis互为姊妹种,支持了蚜蝇亚科Syrphinae的单系性,两种拓扑结构中管蚜蝇亚科Eristalinae均没有聚为一支.该研究结果丰富了蚜蝇科线粒体基因组学基本数据,为进一步深化蚜蝇科系统发育关系讨论提供了参考.
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蚜虫
烟蚜
线粒体基因组
RNA
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系统发育
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文献信息
篇名
访花昆虫野蚜蝇线粒体基因组结构分析
来源期刊
环境昆虫学报
学科
关键词
蚜蝇
线粒体基因组
系统发育
年,卷(期)
2021,(4)
所属期刊栏目
资源昆虫|Natural Enemies and Resource Insects
研究方向
页码范围
992-1002
页数
11页
分类号
Q963|S476
字数
语种
中文
DOI
10.3969/j.issn.1674-0858.2021.04.19
五维指标
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线粒体基因组
系统发育
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研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
环境昆虫学报
主办单位:
广东省昆虫学会中国昆虫学会
出版周期:
双月刊
ISSN:
1674-0858
CN:
44-1640/Q
开本:
16开
出版地:
广州市新港西路105号
邮发代号:
46-18
创刊时间:
1979
语种:
chi
出版文献量(篇)
2184
总下载数(次)
4
总被引数(次)
11888
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