基于TMT和PRM技术的湿性年龄相关性黄斑变性泪液蛋白质组学研究

• 作者: 覃珂 刘丹宁 周希瑗
• 来源期刊: 第三军医大学学报
• 关键词: 湿性年龄相关性黄斑变性 泪液蛋白质组学 串联质谱标签 平行反应监测
• 年，卷（期）: 2021,（6）
• 所属期刊栏目: 基础医学|Basic Medicine
• 页码范围: 473-480
• 页数: 8页
• 分类号: R770.4|R774.5
• 语种: 中文
• DOI: 10.16016/j.1000-5404.202009170

摘要

目的 研究未经诊治湿性年龄相关性黄斑变性(age related macular degeneration,AMD)患者的泪液蛋白质组学,绘制蛋白质图谱,筛选差异表达蛋白以鉴定潜在的生物标志物.方法 以2017年7月至2018年3月于重庆医科大学附属第二医院眼科门诊就诊的33例未经诊治湿性AMD(nAMD)患者和同时期及地点的30例排除眼底疾病的正常老年人泪液为对象,采用串联质谱标签法(tandem mass tag,TMT)对鉴定两组样本的差异表达蛋白进行定量,对所鉴定的差异表达蛋白进行生物信息学分析,并筛选出有潜在研究前景的候选蛋白,并使用平行反应监测(parallel reaction monitoring,PRM)技术靶向验证候选蛋白在人群泪液nAMD中的表达情况.结果 通过TMT相对定量蛋白质组学从未经诊治的湿性AMD患者和正常老年人的泪液中共定量到3 473个蛋白质,其中包含差异表达蛋白382个(122种蛋白上调,260种蛋白下调,P＜0.05),通过GO功能富集分析和KEGG通路富集分析发现这些差异表达蛋白主要参与免疫反应和氧化应激的调节.选择MAOA、Transaldolase和LAMP-2作为潜在的生物标记物,并通过PRM成功验证到这3个候选蛋白的表达情况与TMT定量蛋白质组结果一致.结论 采用TMT相对定量结合PRM靶向验证技术能有效地筛选出湿性AMD与正常人泪液中的382个差异蛋白,并验证提供3种潜在的生物标记物.