乳酸乳球菌乳酸亚种的m6A甲基化差异研究

• 作者: 郑慧娟 李伟程 赵飞燕 蔡虹宇 孙志宏 张和平
• 来源期刊: 中国食品学报
• 关键词: 乳酸乳球菌乳酸亚种 比较基因组学 m6A甲基化
• 年，卷（期）: 2021,（5）
• 所属期刊栏目: 基础研究|Fundamental Research
• 页码范围: 14-22
• 页数: 9页
• 语种: 中文
• DOI: 10.16429/j.1009-7848.2021.05.002

摘要

乳酸乳球菌乳酸亚种是常用的工业发酵剂菌种,具有较高的经济价值.乳酸乳球菌乳酸亚种BL19与IMAU10978的发酵特性存在较大差异,其中BL19具有良好发酵特性.本文比较2株存在明显发酵特性差异的乳酸乳球菌乳酸亚种BL19与IMAU10978,从基因组与m6A甲基化角度探究2株菌的发酵差异化特性.通过单分子实时(SMRT)测序技术对BL19与IMAU10978进行全基因组测序与m6A甲基化鉴定,并结合NCBI全基因组数据,比较不同菌株的功能基因差异和BL19与IMAU10978的m6A甲基化差异.比较基因组分析表明:试验菌株的平均核苷酸一致性高达98.24％,且其功能基因不存在明显差异,均以碳水化合物和氨基酸代谢等为主.甲基化分析显示:IMAU10978与BL19的肽转运载体、PTS系统和2,3-丁二醇脱氢酶等相关基因的m6A甲基化存在明显差异.本研究分析了BL19与IMAU10978的基因组与m6A甲基化,发现2株菌的亲缘关系近且功能基因较为相似,m6A甲基化差异可能是导致发酵特性差异的重要原因.此外,还初步探究工业发酵剂菌株基因组的表观修饰,为工业菌株的选育提供了理论基础.