冬虫夏草菌实时荧光定量PCR内参基因的筛选

• 作者: 苏强军 夏樱霞 谢放 Uwitugabiye VESTINE 陈照禾 周刚
• 来源期刊: 菌物学报
• 关键词: 内参基因 冬虫夏草菌 qRT-PCR 菌丝形态
• 年，卷（期）: 2021,（7）
• 所属期刊栏目: 研究论文|Research papers
• 页码范围: 1712-1722
• 页数: 11页
• 语种: 中文
• DOI: 10.13346/j.mycosystema.210015

摘要

以冬虫夏草单子囊孢子分离得到的菌株TZ8-1的3种菌丝形态为实验材料,提取RNA,经反转录获取cDNA,选择了 11个持家基因为候选内参基因(18SrRNA、APRTase、β-TUB、RPL2、EF1-α、PGI、PGM、H+-ATPase、ACT1、UBQ和GAPDH),根据该菌基因组注释结果来设计引物,采用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)技术进行定量扩增,利用geNorm、NormFinder和BestKeeper算法程序进行表达稳定性评估,并用RefFinder对评估结果进行综合排比,最终筛选得到了最适内参基因.结果表明,所选取的11个候选内参基因均可作为冬虫夏草菌菌丝体时期的内参基因,稳定性最好的3个内参基因分别是UBQ、PGE和ACT1,稳定性较差的3个内参基因分别是GAPDH、RPL2和β-TUB.