1株人乳头瘤病毒6型山东地方株的全基因组序列分析

• 作者: 张翠 纪峰 林小娟 寇增强 徐爱强 陶泽新 宋艳艳
• 来源期刊: 病毒学报
• 学科: 医学
• 关键词: 人乳头瘤病毒6型(HPV6) 全基因组 序列分析 系统发生
• 年，卷（期）: 2021,（6）
• 所属期刊栏目: 人类病毒研究论著|Human Virus Articles
• 页码范围: 1370-1375
• 页数: 6页
• 分类号: R373.9
• 语种: 中文
• DOI: 10.13242/j.cnki.bingduxuebao.003956

摘要

人乳头瘤病毒6型(Human papillomavirus type 6,HPV6)是引起生殖器疣与复发性喉乳头瘤的主要病原体之一.为明确2019年济南市1例尖锐湿疣患者的病毒基因组序列特征,本研究提取其尖锐湿疣组织标本总DNA,分两段进行HPV6全基因组PCR扩增和步移法Sanger测序,将拼接后的序列与全球36条不同来源的HPV6全基因组序列进行对比分析.结果 显示,1013/19/JN/CHN/HPV6株(以下简称1013/HPV6)基因组全长8031bp,属于变异谱系B1,与全球不同地区HPV6分离株序列的同源性为98.4％～99.9％.1013/HPV6株与B1亚谱系参考株AF092932全基因组序列相比具有19个核苷酸变异位点,分布在7个开放阅读框架(Open Reading Frames,ORFs)和非编码区内.本研究首次分析了分离自中国大陆的HPV6全基因序列特征,研究结果为HPV分子进化的进一步研究和分型诊断试剂的优化提供了数据.