喉鳞状细胞癌m6A相关基因预后预测模型的构建及分析

• 作者: 韩弈垣 王雪梅 贺晴 曹晓林
• 来源期刊: 医学研究杂志
• 关键词: 喉鳞状细胞癌 N6-甲基腺苷 TCGA 预后模型
• 年，卷（期）: 2021,（6）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 88-93
• 页数: 6页
• 分类号: R73
• 语种: 中文
• DOI: 10.11969/j.issn.1673-548X.2021.06.020

摘要

目的 构建基于N6-甲基腺嘌呤(N6-methyladenosine,m6A)相关基因的喉鳞状细胞癌(laryngeal squamous cell carcinoma,LSCC)预后预测模型.方法 从TCGA数据库下载LSCC RNA-seq数据及相关临床数据,利用R4.0.3软件筛选并提取LSCC组织中显著差异表达的m6A相关基因(P＜0.05).利用Lasso回归算法构建预后预测模型,并根据风险评分公式计算各临床样本的风险系数,取中位数将样本分为高风险组和低风险组,然后使用Kaplan-Meier生存曲线和受试者工作特征(re-ceiver operating characteristic,ROC)曲线评估该模型效能,并进一步使用单因素及多因素COX回归分析对该预后预测模型进行独立预后分析.结果 LSCC组织中显著差异表达的m6A相关基因共有9个(METTL3、YTHDF1、YTHDC2、ALKBH5、HNRNPC、RBM15、WTAP、FTO和KIAA1429),在此基础之上利用Lasso回归算法构建了预后预测模型.Kaplan-Meier生存曲线显示高风险组的总体生存率明显低于低风险组,且两组的5年生存率之间比较,差异有统计学意义(P＜0.01).ROC曲线显示该模型具有较好的敏感度和特异性(AUC＞0.7).独立预后分析显示该评分模型可作为独立预后因素(P = 0.000)对LSCC患者的预后进行预测.结论 本研究构建了基于m6A相关基因的预后预测模型,且可作为独立的预后因素.