2014-2019年揭阳市登革病毒E基因序列分析

• 作者: 方琪 林耿辉 俞憬 方桂真 张欢
• 来源期刊: 热带医学杂志
• 关键词: 登革病毒 E基因 序列分析
• 年，卷（期）: 2021,（7）
• 所属期刊栏目: 实验研究论著|Experiment Research
• 页码范围: 844-848
• 页数: 5页
• 分类号: R373.33
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1672-3619.2021.07.008

摘要

目的 探讨揭阳市登革病毒(DENV)的分子特征并进行生物学溯源.方法 收集2014-2019年揭阳市登革热流行期间登革热疑似和临床诊断病例的急性期血清,用实时荧光定量RT-PCR方法检测病毒核酸及分型,阳性标本进行病毒分离及鉴定,扩增并测定部分分离株E基因序列,用生物学软件进行序列比对分析并构建系统进化树.结果 896份急性期血清中DENV核酸阳性556份,阳性率为62.05％;血清型以DENV-Ⅰ为主(534例,占96.04％),其次为DENV-Ⅱ(18例,占3.24％).序列分析显示,DENV-Ⅰ分离株基因型分属Ⅰ型和V型,以Ⅰ型为主;DENV-Ⅱ分离株基因型均属于Cosmopolitan型.DENV-Ⅰ、DENV-Ⅱ分离株与周边地市、珠三角城市及东南亚国家流行株同源性较高.DENV-Ⅰ、DENV-Ⅱ分离株均属于弱毒株.结论 2014-2019年揭阳市登革病毒以血清Ⅰ型基因Ⅰ型为主,其次是血清Ⅱ型基因Cosmopolitan型;推测揭阳市登革热流行毒株多来源于周边地市、珠三角城市及东南亚国家.