2007-2020年上海市布鲁氏菌分离株分型方法研究

• 作者: 高芬 陈洪友 屠丽红 庄源 张曦 陈敏
• 来源期刊: 疾病监测
• 关键词: 布鲁氏菌属 多位点序列分析 多位点可变数目串联重复序列分析 全基因组测序 基因型
• 年，卷（期）: 2021,（7）
• 所属期刊栏目: 技术与方法|Technology and Method
• 页码范围: 696-701
• 页数: 6页
• 分类号: R211|R378.5
• 语种: 中文
• DOI: 10.3784/jbjc.202103080105

摘要

目的 对2007-2020年上海市人间布鲁氏菌分离株进行分子特征分析,了解菌株基因分型和聚类,为布鲁氏菌病(布病)的预防和控制提供依据.方法 收集2007-2020年上海市人感染布鲁氏菌临床分离株20株;采用生化方法和AMOS-PCR进行鉴定;运用多位点序列分型(MLST)、多位点可变数目串联重复序列分析(MLVA)和基于全基因组测序的单核苷酸多态性(SNP)分析3种方法进行分子分型;并与参考株进行聚类分析.结果 20株布鲁氏菌均为ST8型羊种布鲁氏菌;被MLVA-8分为4个基因型,MLVA-16分为17个基因型,panel 2B具有多态性;SNP分析表明,20株临床分离株亲缘关系较近,与羊种布鲁氏菌聚类.结论 20072020年上海市人感染布病分离株主要为ST8型羊种布鲁氏菌,分子分型方法可为上海市布鲁氏菌的溯源研究提供依据.