闽西南黑兔NPFFR2基因的克隆与序列分析

• 作者: 桑雷 孙世坤 陈冬金 王锦祥 高承芳 陈岩锋 谢喜平
• 来源期刊: 福建农业学报
• 学科: 农学
• 关键词: 闽西南黑兔 NPFFR2 基因克隆
• 年，卷（期）: 2021,（11）
• 所属期刊栏目: 动物科学|Animal Science
• 页码范围: 1344-1350
• 页数: 7页
• 分类号: S811.6
• 语种: 中文
• DOI: 10.19303/j.issn.1008-0384.2021.11.012

摘要

[目的]神经肽FF受体2(Neuropeptide FF receptor 2,NPFFR2)是机体重要的神经内分泌因子神经肽FF(Neuropeptide FF,NPFF)的受体,参与糖皮质激素和焦虑行为的调节.测序分析闽西南黑兔NPFFR2基因,为其作为闽西南黑兔抗应激研究的重要靶基因提供数据.[方法]克隆NPFFR2基因,并对其进行测序及序列分析.[结果]成功克隆得到闽西南黑兔NPFFR2基因2个转录异构体,分别含1815和1824个核苷酸.它们拥有相同的5′-U T R(Untranslated region,非翻译区)和编码区序列(Coding region),但是在3′-U T R存在多个突变.根据mRNA二级结构预测结果,3′-U T R的突变致使NPFFR2基因转录异构体的二级结构存在部分差异.通过对兔NPFFR2基因进行遗传进化分析,发现其和人类的相关基因进化关系最近.依据编码序列对NPFFR2蛋白结构和亚细胞分布进行预测,NPFFR2蛋白含414个氨基酸,有7个跨膜α螺旋,是G蛋白偶联受体家族一员.[结论]分离克隆了闽西南黑兔NPFFR2基因的2种转录异构体,并利用生物信息学方法对其转录本和翻译蛋白的结构和功能进行了预测,为进一步高效利用闽西南黑兔NPFFR2基因提供相关理论支持.