苜蓿滑刃线虫线粒体基因组及其系统发育研究

• 作者: 薛清 杜虹锐 薛会英 王译浩 王暄 李红梅
• 来源期刊: 生物技术通报
• 关键词: 苜蓿滑刃线虫 滑刃线虫科 线粒体基因组 Illumina平台 低覆盖全基因组测序
• 年，卷（期）: 2021,（7）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 98-106
• 页数: 9页
• 语种: 中文
• DOI: 10.13560/j.cnki.biotech.bull.1985.2021-0628

摘要

苜蓿滑刃线虫(Aphelenchoides medicagus)是一种兼性植物寄生线虫,可在多种真菌上完成生活史,同时对大豆和苜蓿具有弱寄生性.本研究采用Illumina平台对苜蓿滑刃线虫进行低覆盖全基因组测序,从获得的全基因组序列中提取线粒体基因,并利用"种子"序列进行组装;同时对其中富含AT的非编码部分进行PCR扩增与Sanger测序,将扩增与组装的结果进行拼接,共获得14411 bp的线粒体基因组.基因注释结果显示,苜蓿滑刃线虫共有蛋白编码基因12个,tRNA基因22个,rRNA基因2个,其基因构成和排列与贝西滑刃线虫(A.besseyi)、松材线虫(Bursaphelenchus xylophilus)及拟松材线虫(B.mucronatus)完全相同.基于氨基酸序列的系统发育显示,苜蓿滑刃线虫与贝西滑刃线虫互为姐妹群,且与松材线虫、拟松材线虫处在高度支持的滑刃线虫科单系中.本研究表明,低覆盖全基因组测序法可以成功组装出线粒体基因组的大部分序列,证明了利用该方法获取线虫线粒体全基因组序列的可行性.